Исследования происхождения наземных позвоночных прошли долгий сложный путь, без общих представлений о котором трудно разобраться в теперешнем состоянии проблемы. Ввиду этого мы сочли необходимым проследить эволюцию последней, обращая внимание на историческую последовательность ее развития и на изменения методологических подходов к ней. Дарвин обратил внимание на два немаловажных для филогенетики обстоятельства, которые нередко не принимаются во внимание. А именно, что древние формы сильнее, как правило, отличаются от нынеживущих и что потомки могут обнаруживать большее сходство между собой, чем со своими предшественниками. Таким образом, была подчеркнута, с одной стороны, трудность поисков "затемненного образа предков", а с другой, введен в филогенетику метод исторических рядов форм (как необходимое условие такого, поиска), в которых объединялись современные и ископаемые представители филума. Пытаясь обосновать морфологически идею единства происхождения видов, многие эволюционисты в дальнейшем сосредоточили внимание на сборе фактов в пользу ее доказуемости. В центре внимания оказались общие (типовые) черты позвоночных, которые тщательно прослеживались и анализировались в разных группах.